Standort Tulln: Mit dem UG 2002 wurde das 1994 in Kooperation mit der Veterinärmedizinischen Universität Wien sowie der Technischen Universität Wien gegründete IFA Tulln der BOKU angegliedert und wird als Department für Agrarbiotechnologie, IFA Tulln geführt. Im Jahr 2011 wurde mit der Eröffnung des Universitätszentrums Tulln (UFT) der BOKU-Standort in Tulln erweitert. Heute bildet es gemeinsam mit dem IFA den „BOKU Campus Tulln“.

Versuchswirtschaft Groß-Enzersdorf: Diese wurde 1903 gegründet. Heute umfasst sie 135 Hektar und wird als Versuchsbetrieb mit Schwerpunkt Marktfrucht ohne Nutztierhaltung geführt. Diese Einrichtung ist ein wichtiger agrarwissenschaftlicher Versuchsstandort, der als Forschungs- und Lehrstätte für nachhaltige Landnutzung ausgebaut werden soll. Künftige Schwerpunkte in Lehre und Forschung werden im Bereich Digital/Smart Farming gesetzt. Die Flächen in Jedlersdorf (Gartenbau, Obst- und Weinbau) sowie das dort befindliche Saranhaus bilden eine Außenstelle der Versuchswirtschaft Groß-Enzersdorf. Seit 1959 wird Obstbau an diesem Standort betrieben, seit 1997 eine Weingartenfläche bewirtschaftet.